مدل ساز ی به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی مونومر aβ (۱-۴۲) و aβ (۱-۴۰) ، به منظور مقایسه نقش آن ها در ایجاد بیماری آلزایمر
Authors
abstract
سابقه و هدف: مطالعه های آسیب شناختی، تشکیل پلاک های فیبری و توده های تجمع یافته پپتید آمیلوئید بتا (aβ) را یکی از دلایل بیماری آلزایمر پیشنهاد کرده اند. از آنجا که این بیماری وابسته به ساختار فضایی پروتئین است در این مقاله به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی مراحل آغازین تغییرهای کنفورماسیون دو مونومر از aβ، aβ (1-42) و aβ (1-40) مورد بررسی قرار میگیرد. مواد و روش ها: ساختار nmr دو پپتید aβ (1-40) و aβ (1-42) با کد 1iyt و 1ba4 از بانک اطلاعات پروتئین گرفته شده است. مونومرها در دمای k ۳۱۰ در فشار ثابت ۱ بار در بازه زمانی ۲۰ نانو ثانیه با استفاده از نرم افزار گرومکس شبیه سازی شدند. یافته ها: جذر میانگین مربع انحراف های rmsd، تغییرهای شعاع ژیراسیون و سطح قابل دسترس حلال نشان می دهند که تغییرهای ساختاری و سستی مونومر aβ (1-42) و استعداد آن در تجمع بیشتر از مونومر aβ (1-40) است. نتیجه گیری: مقایسه سطح قابل دسترس حلال نشان میدهد هیدروفوبیسیتی نقش مهمی در ایجاد کانفورماسیون معیوب مونومر aβ (1-42) دارد. سایر خواص از جمله سستی ساختاری نیز aβ (1-42) را مستعد تجمع و ایجاد بیماری آلزایمر نشان می دهند.
similar resources
مدل ساز ی به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی مونومر Aβ (1-42) و Aβ (1-40) ، به منظور مقایسه نقش آنها در ایجاد بیماری آلزایمر
سابقه و هدف: مطالعه های آسیبشناختی، تشکیل پلاکهای فیبری و تودههای تجمع یافته پپتید آمیلوئید بتا (Aβ) را یکی از دلایل بیماری آلزایمر پیشنهاد کردهاند. از آنجا که این بیماری وابسته به ساختار فضایی پروتئین است در این مقاله به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی مراحل آغازین تغییرهای کنفورماسیون دو مونومر از Aβ، Aβ (1-42) و Aβ (1-40) مورد بررسی قرار میگیرد. مواد و روش ها: ساختار NMR دو پپتید Aβ (...
full textمقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure
کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...
full textنقایص میتوکندری و استرس اکسیداتیو در بیماری آلزایمر
مقدمه: بیماری آلزایمر شایع ترین بیماری وابسته به سن می باشد که با تجمع خارج سلولی پلاک های آمیلوئید بتا (Aβ) و نوروفیبریل های در هم تنیده ی داخل سلولی تائو هایپر فسفریله مشخص می شود. از آنجایی که Aβ یک مولکول مهم در پاتوژنز بیماری آلزایمر می باشد، در تداخل با جنبه های بسیاری از عملکرد میتوکندری از جمله عدم سوخت و ساز انرژی، تولید گونه های اکسیژن فعال (ROS) و تشکیل منافذ عبور می باشد. مطالعات اخ...
full textبررسی رفتار شکست نانوکامپوزیت اپوکسی نانولوله کربنی دودیواره به کمک روش شبیه سازی دینامیک مولکولی
درا ین مطالعه، رفتار شکست نانوکامپوزیت های پایها پوکسی تقویت شده با نانولوله های کربنی دودیواره به روش دینام کی مولکولی بررسی شده است. برای آماده سازی مدل پلیمری، ساختار اتمی دقیق اپوکسی استفاده شده در مطالعات آزمایشگاهی و برای انجام شبیه سازی از پتانسیل های Tersoff و Amber در توصیف رفتار نانولوله کربن و اپوکسی استفاده شد. از میان روش های موجود برای شبیه سازی فرایند ایجاد پیوند عرضی، روشی بهک ...
full textشبیه سازی برخورد نانو قطره به سطح مورب در فرآیند ایجاد پوشش های نانویی توسط دینامیک مولکولی
پوشش دادن سطوح توسط نانوذرات، کاربردهای وسیعی در صنعت دارد. بسیاری از سطوح بصورت مورب در مقابل نازل پاشش قرار میگیرند که باعث برخورد مایل نانو قطره با سطح میشود. در این مطالعه، توسط شبیهسازی دینامیک مولکولی، برخورد نانو قطره با یک سطح مورب بررسی شده و میزان پخش قطره روی سطح مورب و در زوایا و سرعتهای برخورد متفاوت، مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته است. نتایج نشان میدهد که نسبت پخش شدن نانو قطر...
full textمدلسازی به روش هومولوژی و شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین Rab23 انسانی به هدف انجام مطالعات Docking با لیگاند کلسترول
Rab23 یکی از پروتئینهای خانواده Rab می باشد که مسوول تنظیم ادغام و اتصال غشاء ویزیکولها با اندامکهای سلولهای یوکاریوتی می باشد. این پروتئین یک تنظیم کننده منفی خودکار سلولی برای علامت دهی(Signaling) hedgehog در مهره داران است. مسیر علامت دهی hedgehog در رشد اکثر ارگانها و بافتهای مهره داران نقش محوری داشته و ارتباط آن با نقایص مادرزادی و بسیاری از انواع تومورها مشخص شده است. بنابراین دخا...
full textMy Resources
Save resource for easier access later
Journal title:
مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی - مولکولیجلد ۶، شماره ۲۴، صفحات ۴۳-۵۰
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023